Náklady jsou závislé na rozsahu služeb, které klient požaduje. Standardně se skládají ze dvou složek. Je to factoringový poplatek (provize), tj. náklady na celkovou administrativu a správu pohledávek, a úroky, tj. roční úrok z financované částky. Obě položky se vyjadřují v procentech. Do celkové ceny je třeba započítat i případné poplatky dle sazebníku, např. poplatek za internetovou aplikaci eFactoring nebo bankovní poplatky. Celkový náklad se zpravidla pohybuje v rozpětí od 1 % do 2 % z factoringového obratu.
